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高新技术企业认定部门一般是科技部、财政部、税务总局负责全国高新技术企业认定工作的指导、管理和监督。各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构。认定机构下设办公室，由省级、计划单列市科技、财政、税务部门相关人员组成，办公室设在省级、计划单列市科技行政主管部门。
高新技术企业认证可以享受税收减免优惠政策，经认定的高新技术企业，可执行15%（认定前25%）的优惠税率，税率降低10个点，税额减少40%。 高新技术企业认证可以提高企业市场价值，证明企业在本领域中具有较强的技术创新能力、技术开发能力，有利于企业开拓国内外市场；是企业投标时的重要条件。 同时提高企业资本价值，高新技术企业是吸引地方、行业组织对企业实施优惠政策和资金扶持的重要条件，也更具有吸引风险投资机构和金融机构的实力，从而推动企业快速投入到产业化经营中去。
固定资产折旧与长期待摊费用3.1难点 固定资产折旧与长期待摊费用摊销，是指为开展研究开发活动购置的仪器和设备以及研究开发项目在用建筑物的折旧费用，包括研究开发设施改建、改装、装修和修理过程中发生的长期待摊费用。3.2应对措施 a.检查固定资产明细账、长期待摊费用明细账；检查申报企业年度新增固定资产及长期待摊费用的、固定资产的申购单、入库单、验收单；实地查看该部分设备，核对资产用途（检查使用说明书等），确定其是否真实存在，是否用于研究开发项目。 b.结合固定资产盘点，核对与研究开发活动相关的固定资产是否账实相符；检查购入时已计入研究开发费用的固定资产，是否单管理，是否存在重复计提折旧的情况。 c.复核各项折旧、摊销的准确性及相关性，关注前后各期折旧政策及方法的一致性d.对属于多个项目使用的，检查分摊方法是否合理，且前后各期是否保持一致，分摊的金额是否正确。
